针对山东地区物种特点过敏原数据库的构建

　　【摘要】通过借鉴其他过敏原数据库。利用图书馆和网络资源搜集、查找、核对并收录符合山东地区地理环境、物种分布特点的过敏原信息。建成数据库并公布于互联网上。供消费者免费查询过敏原的物种来源、名称、过敏原蛋白在蛋白质网的统一登陆号、分类学名称、通用拉丁名、通用英文名、抗原表位、结构、糖蛋白构成、过敏原蛋白性状描述等信息。该数据库对摸清山东省过敏原的大致种类。方便过敏原信息的查询。有针对性地检测过敏原。提高过敏性疾病的防治水平具有重要意义。

　　【关键词】过敏原；数据库；蛋白质

　　前人们接触过敏原的种类越来越复杂。资料显示。目前已经确认的过敏原已达1500种［1］。发达约30％的人口受过敏性疾病影响［2］。因此。如何预测可能发生的过敏反应。快速有效检测过敏原。对过敏性疾病的预防和治疗至关重要。过敏原的种类和物候环境密切相关。不同或地区由于地理环境和物种分布的不同。形成了特定的过敏原群落。国外一些发达因医学和食品安全的需要。已经建立了针对本国物种特点的过敏原数据库。我国建立类似过敏原数据库对过敏性疾病的防治以及过敏原检测非常有必要。现就建立针对山东地区物种特点过敏原数据库的情况报告如下。

　　1建库目的

　　每个地区因地理环境、气候等差异。物种分布并不相同。过敏素质基因也存在地区和种族多态性聚集性分布的现象。因此。引起过敏的过敏原种类在不同地区存在很大差异。一个人在某一地区居住出现过敏症状。在另一物候条件下不同的地区居住时过敏症状会消失或者加剧。对物候条件相似的地区建立过敏原数据库。可以对本地区过敏原物种进行针对性筛查。可大大缩小过敏原筛查范围。我国使用的过敏原试剂很多来自进口。有些根本不适合我国或山东省的过敏原检测。针对地区物种分布特点建立过敏原数据库后。可依据此数据库。开发针对某一地区过敏原检测试剂。提高过敏原检测的针对性和准确性。避免使用本地区并不存在的过敏原对病人进行检测。对过敏性疾病的预防和治疗非常必要。还可满足大众对过敏性疾病知识的需求。也为医疗、食品安全、科研工作提供了标准和参考。

　　2建库方法

　　（1）借鉴与山东地区物候相似、物种分布相近的日本食品安全过敏原数据库（allergendatabaseforfoodsafety。ADFS）［3］及其他过敏原数据库。查阅《山东植物精要》、《动物志》、《真菌学》、《昆虫学》。将在山东地区有物种分布的过敏原纳入数据库中。国外数据库中没有。而山东省有的物种。检索国外其他过敏原数据库和国内的有关文献。确定是否为山东省过敏原。如果是。纳入在建的数据库中。并补充相关条目说明。包括过敏原的编号。过敏原的种属。过敏原的蛋白质序列。易致的过敏性疾病种类。引起过敏性疾病的概率。地理分布特点等。

　　（2）建立检索途径：收集完过敏原数据后。将过敏原按动物（animal）、植物（plant）、真菌（fun-gus）、昆虫（insect）、螨虫（mite）、麦角蛋白（gli-adin）、原生动物（protozoan）、蠕虫（worm）、毒液／唾液（venom／salivary）。按过敏原名称（name）、过敏原蛋白统一登陆号（uniprotacc）、分类学名称（taxonamicname）、通用拉丁名（latinname）、通用英文名（englishname）、抗原表位（epitope）、结构（structure）、糖蛋白构成（sugar）、描述（descrip-tion）分别建立检索途径。

　　（3）建立网站连接：将通用拉丁名、通用英文名、抗原表位（epitope）、结构（structure）、糖蛋白构成（sugar）、描述（description）目录下的条目与相应的蛋白质和基因网站建立连接。

　　（4）将建立好的过敏原数据库公布于互联网上。对数据库网站进行更新、维护、完善。过敏原数据库中在过敏原名称和过敏蛋白统一登录号中分别建立了站外链接。目的是通过利用相应核酸数据库和蛋白质数据库给出过敏原分子信息。如基因信息和氨基酸序列信息。由于链接到的站外数据库是实行实时更新。这要求本数据库也要进行定期更新。

　　3数据库简介和应用

　　对物候条件近似的地区建立过敏原数据库。可以对本地区的过敏原有针对性地进行筛查。可大大缩小筛查范围。我国使用的过敏原试剂多来自国外。依据本数据库可开发针对本地区过敏原特点的过敏原检测试剂。提高过敏原检测的针对性和准确性。避免使用本地区并不存在的过敏原对病人进行检测。节省人力和财力。同时对过敏性疾病的预防和治疗非常必要。该过敏原数据库除为医疗、食品安全、科研工作提供了标准和参考外。还可满足大众对过敏性疾病知识的需求。是面向变态反应领域的专业研究人员对过敏原信息查询。也能满足一般大众对过敏原的认识需求。数据库共收录13类。共1043种过敏原。其中食入性动物过敏原49种。吸入性动物过敏原15种、食入性植物过敏原297种、吸入性植物过敏原344种、食入性真菌过敏原1种、吸入性真菌过敏原57种、吸入性昆虫过敏原36种、吸入性螨虫过敏原88种、毒液／唾液过敏原54种、接触性过敏原57种、麦角蛋白过敏原23种、蠕虫过敏原20种和原生动物过敏原2种。数据库中收录的784种过敏原源自山东地区的113个物种。用户键入http：／／www。gmycx。com。进入数据库首页。显示数据库简介、搜索方法、过敏原检索栏。搜索的方法包括过敏原种类搜索、过敏原物种检索、过敏原名称搜索和模糊搜索四种方法。使用任意一种搜索方法均可以查到过敏原相关信息。包括过敏原的名称。源自物种的拉丁名、英文名、中文名。过敏原统一登录号。蛋白质和核酸结构、糖蛋白以及相关描述。

　　目前国外过敏原数据库的一个重要功能是采用比较蛋白质序列与已知过敏蛋白质序列相似度的方法［3-4］对过敏性分子的致敏性进行评估。这种功能可以用于食品商业化前的安全性评估。还可以对通过转基因编码的蛋白质与已知过敏原进行序列相似性比较。为转基因食品商业化前的安全性评估提供重要依据。过敏原数据库与蛋白质数据库和核酸数据库链接提供过敏原的蛋白质和核酸编码信息。在转基因技术中。可以避免将编码过敏原蛋白的目的基因引入转基因物种。避免新型过敏蛋白的产生。由于技术、资金限制。本数据库尚不具备蛋白质序列分析、蛋白质空间结构分析以及致敏性评估功能。仅能作为过敏原知识的信息平台供用户及研究人员查询使用。

　　参考文献

　　［1］Aplatformforallergenknowledge［EB／OL］。［2010-05-21］。

　　［2］KambleS。BharmalM。Incrementaldirectexpenditureoftrea-tingasthmaintheUnitedStates［J］。JAsthma。2009。46（1）：73-80。

　　［3］PearsonWR。LipmanDJ。Improvetoolsforbiologicalsequencecomparison［J］。ProcNatlAcadSciUSA。1988。85（8）：2444-2448。

　　［4］AltschulSF。GishW。Basiclocalalignmentsearchtool［J］。JMolBiol。1990。215（3）：403-41

　　程芳1康尔恂2

《针对山东地区物种特点过敏原数据库的构建》

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