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基于SSR的四川榛子资源亲缘关系研究

来源:职称论文发表咨询网作者:田编辑时间:2021-09-11 10:42
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  摘要四川是榛子资源的一个重要分布区,国内野生榛子资源至少有7种在本区有分布。本研究使用9个SSR标记分析了川榛(Corylusheterophyllavar.sutchuenensis)、滇榛(C.yunnanensis)、刺榛(C.ferox)、毛榛(C.mandshurica)与欧榛(C.avellana)资源的群体遗传多样性与亲缘关系。结果显示检测的11个群体的有效等位基因数、观察杂合度、期望杂合度、Shannon’s信息指数均值分别为2.772、0.644、0.546、1.016,说明群体的遗传多样性处于中等水平,且茂县川榛与泸定滇榛群体多样性水平较高。同时主坐标分析与UPGMA聚类分析显示毛榛与欧榛的亲缘关系较近,川榛与滇榛的亲缘关系也较近。本研究有助于推动四川榛属资源的良种选育与保护利用。

  关键词榛子;简单序列重复;遗传多样性;亲缘关系

  榛属(CorylusL.)植物,为落叶小乔木或灌木,较少为乔木,约有20余种,分布于亚洲、欧洲与北美洲。我国有10个种(变种),主要原生分布在西南地区与东北、华北、西北三北地区[1]。榛属植物种子不但含油丰富,还富含蛋白质、维生素及矿物质元素,为世界“四大坚果”之一,可直接食用,在巧克力、糖果、奶制品及焙烤食品产业中也广泛应用,具有较高的经济价值[2]。我国辽宁省经济林研究所等单位自20世纪60—80年代先后开展了欧榛引种、平榛选育以及平榛与欧榛的杂交育种研究,并于1999年开始选育出了一系列平欧杂交榛子良种,目前已在三北地区与山东、安徽等地推广,填补了国内榛子栽培品种的空白,开启了我国榛子园艺化栽培与产业发展的新时代[2-3]。

基于SSR的四川榛子资源亲缘关系研究

  1材料与方法

  1.1材料选择

  54份榛子资源参与本项目研究,具体信息见表1,其中欧榛为国外引进资源。采集新鲜叶片,使用变色硅胶干燥,并保存于-80℃冰箱备用。

  1.2方法

  利用9对SSR引物对样品进行分型分析,引物信息、基因组DNA提取、PCR扩增体系、程序与SSR产物电泳分型桐以前研究[15]。遗传参数采用GenAlEx6.51b2软件计算[16],个体Nei’s遗传距离利用NTSYS-pc2.10s计算、并进行UPGMA聚类分析[17],利用计算的参数对参试榛子群体遗传多样性与亲缘关系进行解析。

  2结果与分析

  2.1榛子资源遗传多样性与遗传结构

  本文使用SSR分子标记技术对54份榛子资源进行了遗传多样性分析,SSR位点遗传参数见表2。其中,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon's信息指数(I)、观察杂合度(Ho)、期望杂合度(He)分别介于2.455~5.000、1.877~4.083、0.667~1.461、0.445~0.818、0.381~0.732之间。平均每个位点扩增出3.596个等位基因,Ch07检测到的平均等位基因数最多、为5.000,Ch03检测到的最少、为2.455。平均有效等位基因数为2.772,其中最多的位点是Ch07、为4.083,而Ch08最少、为1.877。有效等位基因数、杂合度与Shannon’s信息指数反映了群体等位基因分布的丰富与均匀程度[18]。本研究中,11个群体的有效等位基因数介于2.030~3.427之间、均值,观察杂合度范围介于0.467~0.756,期望杂合度变动于0.396~0.678,Shannon’s信息指数范围为0.680~1.296,4个参数的均值分别为2.772、0.644、0.546、1.016(见表2)。基于上述数据,参试的11个榛子群体的遗传多样性处于中等水平,且11个群体中茂县川榛(C)与泸定滇榛(B)群体多样性水平较高,而盐源滇榛(E)与茂县毛榛(O)群体遗传多样性水平较低。

  2.2榛子资源亲缘关系

  基于参试个体的遗传距离,分别进行了Populationassignment(见图1)分析与主坐标(PCoA)分析(见图2)。Populationassignment分析则显示刺榛、毛榛与欧榛为1类,川榛与滇榛为1类。主坐标分析显示榛子资源分为刺榛、毛榛与欧榛、川榛与滇榛3类。说明毛榛与欧榛的亲缘关系较近,川榛与滇榛的亲缘关系也较近。进一步利用个体Nei’s遗传距离构建UPGMA聚类图(见图3),结果显示相关系数为0.31时,54个榛子种质资源个体可聚类为毛榛、欧榛、刺榛、川榛与滇榛4类。而且从聚类图上可以看出毛榛与欧榛的亲缘关系较近,川榛与滇榛的亲缘关系也较近,与主坐标分析结果相似,也与王艳梅的结果相一致[4]。

  3讨论

  本研究使用9个SSR分子标记分析了四川不同县域的川榛、滇榛、刺榛、毛榛与引进的欧榛资源的群体遗传多样性与亲缘关系,结果显示参试的榛子群体的遗传多样性处于中等水平,且川榛与滇榛的亲缘关系较近,毛榛与欧榛的亲缘关系也较近。一般来说,在较近的地理区域内,由于环境与气候条件比较接近,自然选择压力趋于一致,在一定程度上增加了种间的基因交流,因此地理较近的种遗传相似性较大、亲缘关系较近。川榛与滇榛的亲缘关系较近也说明了这一点,川榛主要分布于阿坝州,滇榛主要分布于凉山州,而且根据文献资料与我们的调查,川榛与滇榛在凉山冕宁、甘孜泸定均有分布。而毛榛与欧榛地理距离远、亲缘关系较近,川榛与毛榛(参试资源分布于茂县)、刺榛与滇榛(冕宁均有分布)亲缘关系相对较远,可能跟其进化历史有关。Bassil等通过研究认为:亚洲在冰期是榛属植物的避难地,随后其通过地中海扩散到欧洲,通过大西洋陆桥与(或)白令陆桥扩散到北美洲[21],与桦木科桤木属植物系统发育相一致[22]。因此,我们推测在进化历史上毛榛与欧榛可能有较近的共同祖先,而川榛与毛榛、刺榛与滇榛尽管目前地理距离较近,然而进化历史上却来自不同的分支。当然,这种推测需要进一步的研究来证实。对于杂交育种,从本文研究结果来说,川榛与滇榛、毛榛与欧榛可能比较容易得到杂交子代,当然这也需要下一步的试验结果来验证。同时对四川榛子资源来说,尽管目前采集到了部分资源,然而部分资源数量不足,藏刺榛、披针叶榛目前尚未采集到资源,因此要对四川榛子资源进行较全面的评价与利用,也需要进一步的调查与研究。

  参考文献

  [1]匡可任,李沛琼,郑斯绪,等.植物志(21卷)[M].北京:科学出版社,46?55,1979.

  [2]张宇和,柳鎏,梁维坚,等.果树志板栗榛子卷[M].北京:林业出版社,193?217,2005.

  [3]王贵禧.榛属植物资源培育与利用研究(Ⅲ)—育种、育苗与栽培[J].林业科学研究,2018,31(1):122?129.

  [4]王艳梅,苏淑钗,翟明普,等.榛属植物遗传关系的SSR分析[J].东北林业大学学报,2008,36(11):48?51.

  [5]王艳梅,翟明普,马天晓,等.榛属7种植物与虎榛微卫星测序及分析[J].华中农业大学学报,2009,28(1):5?10.

  [6]王艳梅,苏淑钗,翟明普,等.榛属植物SSR反应体系的建立[J].华中农业大学学报,2007,26(5):689?692.

  王泽亮*,吴斌,邢文曦,郑崇文,李丕军


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